Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCF2P10911 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCF2P10911 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCF2P10911 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms