Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI3P10071 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI3P10071 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms