Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALM2P0DP24 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms