Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF1P09603 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSF1P09603 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSF1P09603 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSF1P09603 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF1P09603 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF1P09603 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF1P09603 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSF1P09603 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms