Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP10P09238 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP10P09238 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP10P09238 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP10P09238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MMP10P09238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP10P09238 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms