Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGB3P05106 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGB3P05106 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms