Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP10AO60312 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP10AO60312 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP10AO60312 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP10AO60312 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP10AO60312 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP10AO60312 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP10AO60312 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP10AO60312 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms