Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms