Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTRA2O43464 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTRA2O43464 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms