Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRTM2O43300 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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