Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms