Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms