Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLGNO14967 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLGNO14967 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLGNO14967 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLGNO14967 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLGNO14967 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms