Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms