Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ODF3BA8MYP8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3BA8MYP8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3BA8MYP8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ODF3BA8MYP8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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