Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTL1A6NKG5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms