Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX2A2RU54 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HMX2A2RU54 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms