Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV25-1A0A075B6N4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV25-1A0A075B6N4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV25-1A0A075B6N4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV25-1A0A075B6N4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV25-1A0A075B6N4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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