Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms