Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS3Q9UPU3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms