Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms