Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF2Q9UNY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms