Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX7Q9UNH6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX7Q9UNH6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms