Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR2

DDX19B, ATP-dependent RNA helicase DDX19B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX19BQ9UMR2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX19BQ9UMR2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms