Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms