Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms