Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms