Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED13Q9UHV7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms