Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms