Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCF2Q9UG63 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms