Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APEX2Q9UBZ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms