Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMG20BQ9P0W2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms