Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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