Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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HOXC10Q9NYD6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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HOXC10Q9NYD6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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