Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms