Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms