Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPJQ9HC77 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPJQ9HC77 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms