Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD3Q9H7E2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms