Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms