Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms