Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL4Q9C0H6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms