Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TM6SF1Q9BZW5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM6SF1Q9BZW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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