Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL445248.1-201ENST00000366152 624 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP13-3-201ENST00000390690 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007036.2-201ENST00000415934 437 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018641.1-201ENST00000435950 796 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004448.4-203ENST00000456537 441 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001001.2-201ENST00000524966 409 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000873.3-201ENST00000531869 766 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012146.3-201ENST00000574352 490 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079779.3-201ENST00000588842 1200 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002856.2-202ENST00000606885 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMZ2-205ENST00000577866 1492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4C12-201ENST00000335238 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP13A4-AS1-201ENST00000426459 795 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRYZP1-201ENST00000428923 947 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms