Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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MAP1LC3CQ9BXW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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