Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK-6Q9BXR3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK-6Q9BXR3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms