Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms