Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FNDC11Q9BVV2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms