Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms