Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms