Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD1Q9BUP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms